医院现有国家级重点专科（含建设专科）6个、重点培育专科3个，省级重点专科32个,下表覆盖医院核心重点专科。
| 科室 | 复旦专科榜排名(年份) | 国家重点学科(年份) | 国家临床重点专科(年份) | 省重点专科(年份) | 市重点专科(年份) | 院优势专科 | 挂靠中心/实验室资质 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 肝胆外科（肝胆医院） | 普通外科获华中区提名（2023年度） | 否 | 国家临床重点专科（官网口径） | 省临床重点专科（2020，普外与肝胆外科） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省胆道疾病防治临床医学研究中心、胆道疾病防治湖南省重点实验室，设9个病区、开放床位440张 |
| 急诊医学科 | 华中区第3（2023年度） | 否 | 国家临床重点专科建设单位 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省急救医学研究所、急危重症代谢组学湖南省重点实验室、《实用休克杂志》、AHA心血管急救培训基地、湖南省急救中心 |
| 全科医学科 | 华中区第2（2023年度） | 否 | 否（住培全科专业基地为国家重点基地） | 官方未统一披露 | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省医学会全科医学专业委员会主委单位 |
| 心血管内科 | 心血管病未入华中区前5及提名（2023年度） | 否 | 国家疑难病症诊治能力提升工程项目建设专科（培育口径） | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 国家心血管病区域医疗中心建设单位、湖南省心力衰竭临床医学研究中心、国家级胸痛中心（省内首家，示范基地） |
| 泌尿外科 | 华中区提名（2023年度） | 否 | 国家临床重点专科建设项目（2021，前列腺方向） | 省临床重点专科（2022，前列腺、结石方向） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省老年医学研究所下尿路及盆底功能疾病研究中心、长沙市前列腺疾病技术创新中心、湖南省医学学科建设项目（2025） |
| 儿科（儿童医学中心） | 小儿内科获华中区提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 儿童呼吸病学湖南省重点实验室、中国医师协会儿科医师分会副会长单位 |
| 呼吸内科 | 呼吸科未入华中区前5及提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 儿童呼吸病学湖南省重点实验室（共建）、呼吸治疗专科（急诊体系） |
| 消化内科 | 消化病获华中区提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省医学会消化专业委员会主委单位、内镜中心 |
| 神经内科 | 神经内科未入华中区前5及提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省脑血管病康复临床医学研究中心、卒中中心 |
| 肾内科（肾脏与免疫科） | 肾脏病获华中区提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省慢性肾脏病临床医学研究中心、血液净化中心 |
| 骨科（骨科医学中心） | 骨科未入华中区前5及提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省运动医学临床医学研究中心、骨科与运动医学中心 |
| 老年医学科（老年医学中心） | 老年医学未入华中区前5及提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 国家老年病区域医疗中心建设单位、湖南省老年医学研究所 |
| 康复医学科 | 康复医学获华中区提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省康复医学会挂靠单位、康复医学中心（马王堆院区） |
| 临床护理 | — | 否 | 国家重点专科（护理） | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 护理专科门诊、伤口造口中心；2024年住院患者满意度国考满分 |
| 影像与介入科（介入医学中心） | 超声医学获华中区提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020，医学影像科） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省介入医学临床医学研究中心、湖南省医学会介入医学专业委员会主委单位、出血中心 |
| 美容与整形外科 | 整形外科获华中区提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020） | 官方未统一披露 | 是 | 湖南省医疗整形美容协会挂靠单位、瘢痕与创面修复中心 |
| 药学部（药剂科） | 临床药学未入华中区前5及提名（2023年度） | 否 | 否 | 省临床重点专科（2020，临床药学） | 官方未统一披露 | 是 | 国家药物临床试验机构、药物咨询窗口 |
口径说明：①"国家临床重点专科"与"国家临床重点专科建设项目"为不同口径，年份以官方正式清单为准；医院官网口径为"国家级重点专科（含建设专科）6个、重点培育专科3个"，逐科完整名单官方未统一披露，上表按已公开科室逐一标注。②省重点专科2020年度批次（湘卫函〔2020〕538号）该院14个专科入围、居全省第一；截至2025年11月医院口径为省级重点专科32个，逐科名单官方未统一披露。③市（长沙市）级重点专科逐科名单官方未统一披露，均如实标注，不作编造。④复旦排名为专科声誉榜华中区名次，名次以复旦版当年发布为准。
